El servicio de gastroenterología diagnostica y trata las enfermedades del tubo digestivo así como las relativas al hígado y páncreas, disponiendo de medios para realizar pruebas complementarias como radiología digital normal y de contraste, ecografía, análisis de sangre, plasma y de orina.

También dispone de endoscopios flexibles de diferentes tamaños para la realización de esófago-gastroscopias y colonoscopias., lo que permite la toma de muestras para estudios anatomopatológicos sin necesidad de una intervención quirúrgica.